萧并非是从一开始就如此想的，他是在确认了老版与新剧场版的联系后才会如此去思考与推论，其中让他有这种感觉最大的一个，那就是EVA了，不，确切的说，是EVA初号机。
EVA初号机的实力，在老版和新剧场版中有了天翻地覆质一样的变化，在老版中，除了AT力场以外，其余基本上还是符合最基础的物理法则，或者说至少是拳拳到肉类型的物理性质机体，但是到了新剧场版中，当EVA初号机觉醒之后，直接就从科技类转变成了奇幻类，而且还是那种最顶级的奇幻类，虽说萧已经见识过了罗杰面对使徒时的战力，那确实是极为夸张的实力，但是他并不觉得面对觉醒后的EVA初号机，罗杰可以直接碾压。
虽然从动画角度来说，内部的人物要有多强就可以设定为多强，直接设定出创世神都可以，而且老版的动画和再创作的新剧场版，有剧情上的偏差与变化这是很正常的，反正都是编剧在弄，但若是从动画变成了真实不虚的现实世界的话，那么所谓的老版与新版，就有着了必然的联系。
那么，是什么样的情况可以让世界再一次重新构造重新复原，然后再一次开始，除了某些细节以外，大体上都没改变呢？又是什么样的情况可以让本来物质化的EVA初号机，在碇真嗣的觉醒下成为“神”呢？
萧在得到了这些问题之后，就借着这些问题提出了假设，然后再去除其中的错误与不可能，最后得到的答案是……
人类补完计划已经完成！
是的，若做一个假设，人类补完计划在老版的世界，甚至老版以前可能存在的无限多的EVA世界中已经完成，然后补完后的存在，不满意这次的结局，或者对某些地方不满意，或者是对想要的世界出现了偏差，又或者无限多的可能，然后这个补完后的存在产生了一个希望。
“啊，如果世界再来一次，这一次一定……”
萧在脑海里模拟出了碇真嗣或者是碇源堂这样的声音，然后能够如同如果电话亭那样随意改变与改造世界的存在，嗖的一下把时间，不，是把整个世界，时间，空间，物质，能量，这最基础的四大要素给一下子改变了呢？
得出了这样的假设后，确实可以解释清楚很多事情，但是又有一些事情没办法解释清楚，那就是SEELE的存在，如果真是人类补完成功，并且大成了如果电话亭那样的能力，那么每一次重复的世界里，为什么还会有SEELE的存在呢？
这是一个巨大的矛盾点，因为如果是碇真嗣作为补完者，他是不可能那么深刻知晓SEELE存在的，而且那怕是知晓了，他也不可能让SEELE存在下去，而如果是碇源堂作为补完者，那么处于同样的理由，SEELE也同样不可能继续存在。
所以在这里，萧做出了两个完全截然相反的假设，一个是补完后的主体能力太强，那种类似大愿望术，或者类似如果电话亭的效果太强，导致完全重来的世界是彻底的真实重来，所有的一切，包括了SEELE，而另一个可能则是补完有缺陷，而且是致命的缺陷，因此导致了这种重来无法奈何掌握了超级黑科技的SEELE，而SEELE就会在新世界里重新出现。
无论是哪一种假设，其中都有一个共同点，那就是SEELE对人类补完后所产生的效果是有认知的，并且很可能是有着几乎完全的认知，同时还可能有着应对办法，而在这样的基础上，萧提出了第三个假设，也是最终假设。
那就是SEELE内部人员，对待人类补完计划开始有了分歧，并不是碇源堂本身，而是那些从没以真实样貌出现过的SEELE主体人员，他们内部中很可能有了分歧者。
这个假设的来由是因为之前那些假设所得出的结论，也即人类补完计划已经完成了许多次，甚至是无数次，但是因为某些缺陷或者是意外，导致了一直重复，并且再启动新的世界，这样一次一次下来，从这样的一个结论中得到了最后一个假设，也即SEELE的主体人员中产生了矛盾，否则不可能每一次都会产生同样的人类补全计划，最多只是细节有些偏差。
由此，萧得到了一个他自己推论出来的真相，那就是……
SEELE想要实行的人类补完计划，其实更准确的说法，应该是创世神，或者说创造者计划，这个计划的最终产物已经完全和人类无关，若是真要形容的话，SEEELE想要创造的，是一个依靠意识，依靠思维，依靠自己的想法就可以创造一个其心中所想要的世界的神！
若要比喻，这个神就和一本小说的作者，一本剧本的编剧那样，对于其小说，对于其剧本，这个补完出来的存在是无所不能！
这个真相还没完毕，同时，在创造这个东西，或者说补完出来时，SEELE内部的人员对于其结果，或者别的什么，比如瑕疵，比如效果，比如结局，比如任何东西产生了不满或者不解，由此导致了SEELE内部中出现了分歧。
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